ДНК

Часто думаю чего в нас больше — генетики, влияния среды, воспитания? Насколько много мы на са́мом деле передаём детям, а что является результатом случайных процессов, которые от нас совершенно не зависят?

У меня перед глазами есть такой пример: жена в детстве грезила лошадями — мечтала, что когда-нибудь будет на них кататься, постоянно рисовала. К сожалению, в её детстве это было недостижимо по разным причинам.

Сейчас дочка и жена сходят с ума по этим животным на пару — сначала мы раз в неделю начали возить на занятия дочку, потом подтянулась и жена. Любовь настолько велика, что, кажется, предложи дочке в три ночи, в холод и буран «покататься на лошадках», она не откажется. Жена же уже примеряется деньгами к владению собственной лошадью.

Дочка с лошадкой Линдой на свой позапрошлый день рождения

Вот интересно — что это? Есть ли ген любви в лошадям? Или каким образом жена свою любовь к ним индуцировала настолько мощно, что это захватило и дочку тоже? Почему это не работает всегда? Ведь у нас с женой на двоих много предпочтений и вещей, по которым мы маньячимся, почему именно кони?

Впрочем, моя любовь куда-нибудь взобраться пестуется теперь и в дочке занятиями по скалолазке, она там по стенам взбирается, как человек-паук. А любовь к плаванию, вероятно, от деда, моего папы — он как-то сказал, что три года в морфлоте были лучшими в его жизни.

Посмотрим прорастёт ли программирование, любовь к чтению и старине.

Проживание в Татарстане любопытно на меня влияет: всего за полгода я стал на семь процентов больше татарином, чем русским. Теперь я татарин больше, чем на четверть.

Повысил количество татарских генов у себя в ДНК на 7% усилием воли, а чего добился ты?

А если серьёзно, этнический состав по ДНК определяют на основании статистики, это примерные данные. Чем больше собрано статистики, тем точнее определяется этот показатель.

«Генотек», куда я сдал свою ДНК на анализ полгода назад, недавно пересчитал данные по обновлённой статистике, с учётом тех данных, которые были собраны за последнее время. Пересчитают когда-нибудь ещё раз и цифры опять изменятся, причём в любую сторону.

Ещё со времени прохождения своего первого генетического исследования на американском сервисе в 2014 году, планировал сделать то же в какой-нибудь российской компании.

К тому анализу, помимо любопытства, меня подстегнул поиск родственников — тогда я активно занимался исследованием своего родового дерева и стремился расширить его всеми способами. Сервисы, подобные тому, куда я отослал свою ДНК, ищут совпадения с ДНК остальных клиентов и показывают тех, кто достаточно близок друг к другу по родству.

Хотя и я узнал о себе много разной другой информации (например, какие-то вещи, на которые мне следует обратить внимание, чтобы меньше болеть), с поиском родственников не задалось — за все годы нашлась одна-единственная веточка.

В этом году я решил попробовать вернуться к идее поиска родственников по ДНК, сдав анализы в какой-нибудь российский сервис — всё-таки внутри России встретить своих предков для меня более вероятно.

Из всех конкурентов выбрал «Генотек», зацепили хорошие интерфейсы. Под Новый год у них были хорошие скидки, так что я купил аж три пробирки — себе, жене и её бабушке.

Распределение русского и татарского в моей ДНК с сайта «Генотек»

Хотя в статистике к настоящему моменту у меня значится 544 родственника, зацепиться пока не удалось — нет пересечения по фамилиям, а переписываться с каждым и вместе исследовать деревья у меня как-то нет желания.

Интересный для меня результат оказался в другом — у меня оказался неожиданно высокий процент предков из «народов Волго-Уральского региона». Точнее там не разделяется, видимо не хватает статистики, но предположительно это татары или мишаре — сужу по фамилиям, которые видны в упомянутом выше списке родственников.

Американский сервис давал другое распределение, но это ожидаемо — у «Генотека» наверняка статистика по России куда более объёмная, а определение национальности и её вклада в ДНК возможно только через неё.

Во всём моём дереве видно только одну тюркскую фамилию — Кандауров («хан даур»), но она может дать только чуть больше 6% вклада (1/16), значит татары или мишаре затесались где-то ещё, любопытно.

В начале года я заказывал тест ДНК в компании «Family Tree DNA», в интерпретации результатов компанией, к слову сказать, была ошибка, я ещё напишу об этом, когда история закончится.

Мне ещё тогда в комментариях подсказали сервис «Promethease», который за пять долларов может проанализировать полученные данные и что-то сказать вам по ним о вашем здоровье. К сожалению, ни тогда, ни сегодня заставить работать Promethease с полученными от FTDNA данными не получилось — сервис упорно писал и пишет, что формат ему не знаком.

Пришлось разбираться в чём же дело. В итоге проблему я победил, рецептом делюсь. Во-первых, вам потребуется файл с данными анализа вашей ДНК, я скачал его из раздела FamilyFinder, на скриншоте подчёркнутая красным ссылка внизу:

Этот раздел находится на первой странице в том случае, если вы заказывали одноимённый тест.

В этом разделе у меня пять ссылок, я скачал файл по ссылке «Build 36 Autosomal Raw Data» и совершенно без понятия чем файлы по ссылкам различаются и подойдут ли оставшиеся, с этим я ещё не разбирался.

Далее файл надо распаковать, если ваш браузер ещё этого не сделал. Для этого под «Маком» и «Линуксом» можно воспользоваться утилитой командной строки gzip, а под Виндоузом его распаковывать умеет «WinRAR».

Внутри архива будет файл в формате CSV («значения, разделённые запятой»), его надо сконвертировать в формат 23andme при помощи небольшой утилиты, которую я написал. Лучше её не копировать через буфер обмена (в ней есть символы табуляции, которые важны и могут пропасть), а сохранить на компьютер браузером или как-то иначе.

Как запускать её под Виндоуз я не решусь рассказывать, как-то можно, но я на память не опишу этот процесс, больше пяти лет под этой ОС не работал, на «Маке» и «Линуксе» это делается из командной строки. Полностью процесс выглядит вот так:

# распаковываем архив
gunzip ftdna.csv.gz
# скачиваем утилиту
curl -O https://raw.githubusercontent.com/bolknote/shellgames/master/ftdnato23andme.sed
# делаем файл запускаемым
chmod a+x ftdnato23andme.sed
# конвертируем
./ftdnato23andme.sed < ftdna.csv > 23andme.txt

Получившийся файл 23andme.txt надо залить на Promethease, заплатить пять долларов и минут через двадцать (запросы на обработку данных ставятся в очередь) получите результат. У меня из целая куча «плохих новостей» (так и написано): повышенный риск облысения, 77% вероятности непереносимости лактозы, в три раза выше риск дегенерации мышц с возрастом и ещё ворох подобных «прелестей», «хороших новостей» тоже немало, но там чаще всего «вероятность получения рака простаты не выше нормы» и тому подобное, какие-то поддельные хорошие новости — не радуют.