FTDNA и Promethease

В начале года я заказывал тест ДНК в компании «Family Tree DNA», в интерпретации результатов компанией, к слову сказать, была ошибка, я ещё напишу об этом, когда история закончится.

Мне ещё тогда в комментариях подсказали сервис «Promethease», который за пять долларов может проанализировать полученные данные и что-то сказать вам по ним о вашем здоровье. К сожалению, ни тогда, ни сегодня заставить работать Promethease с полученными от FTDNA данными не получилось — сервис упорно писал и пишет, что формат ему не знаком.

Пришлось разбираться в чём же дело. В итоге проблему я победил, рецептом делюсь. Во-первых, вам потребуется файл с данными анализа вашей ДНК, я скачал его из раздела FamilyFinder, на скриншоте подчёркнутая красным ссылка внизу:

Этот раздел находится на первой странице в том случае, если вы заказывали одноимённый тест.

В этом разделе у меня пять ссылок, я скачал файл по ссылке «Build 36 Autosomal Raw Data» и совершенно без понятия чем файлы по ссылкам различаются и подойдут ли оставшиеся, с этим я ещё не разбирался.

Далее файл надо распаковать, если ваш браузер ещё этого не сделал. Для этого под «Маком» и «Линуксом» можно воспользоваться утилитой командной строки gzip, а под Виндоузом его распаковывать умеет «WinRAR».

Внутри архива будет файл в формате CSV («значения, разделённые запятой»), его надо сконвертировать в формат 23andme при помощи небольшой утилиты, которую я написал. Лучше её не копировать через буфер обмена (в ней есть символы табуляции, которые важны и могут пропасть), а сохранить на компьютер браузером или как-то иначе.

Как запускать её под Виндоуз я не решусь рассказывать, как-то можно, но я на память не опишу этот процесс, больше пяти лет под этой ОС не работал, на «Маке» и «Линуксе» это делается из командной строки. Полностью процесс выглядит вот так:

# распаковываем архив
gunzip ftdna.csv.gz
# скачиваем утилиту
curl -O https://raw.githubusercontent.com/bolknote/shellgames/master/ftdnato23andme.sed
# делаем файл запускаемым
chmod a+x ftdnato23andme.sed
# конвертируем
./ftdnato23andme.sed < ftdna.csv > 23andme.txt

Получившийся файл 23andme.txt надо залить на Promethease, заплатить пять долларов и минут через двадцать (запросы на обработку данных ставятся в очередь) получите результат. У меня из целая куча «плохих новостей» (так и написано): повышенный риск облысения, 77% вероятности непереносимости лактозы, в три раза выше риск дегенерации мышц с возрастом и ещё ворох подобных «прелестей», «хороших новостей» тоже немало, но там чаще всего «вероятность получения рака простаты не выше нормы» и тому подобное, какие-то поддельные хорошие новости — не радуют.