Это сайт — моя персональная записная книжка. Интересна мне, по большей части, история, своя жизнь и немного программирование.

ДНК-портрет

Смотрел недавно своё родовое древо и пытался представить как могли бы выглядеть мои отдалённые предки. Остаётся только фантазировать — к сожалению, ни один из них не был удачлив настолько, чтобы время сохранило его портрет или хотя бы словесное описание.

И мне подумалось — нет никаких сомнений в том, что в недалёком будущем мы сможем довольно точно восстанавливать по ДНК облик его носителя. С какой-то погрешностью, разумеется, так как образ жизни и перенесённые заболевания накладывают свой опечаток, а сведения о них взять неоткуда. Так вот, нельзя ли набрать из ДНК потомков достаточно информации, чтобы с высокой степенью точно выяснить как выглядел предок?

У меня не хватает знаний, чтобы ответить на этот вопрос, но может кто-то из читателей сможет?

Например, берём самый фантастический сценарий: у всех жителей Земли взят анализ ДНК, каждая ДНК секвенирована и лежит в огромной базе данных, где можно моментально производить любой поиск. По этой базе мы строим дерево родственных отношений всего населения Земли между собой, выделяем какую-то ветку, берём всех потомков из неё, смотрим вариативность, отсеиваем мутации и конструируем ДНК их общего предка.

Будет такое работать?

5 комментариев
Сергей 2020

Ошибка раньше. В получении по ДНК — облика.
Очень многое зависит от питания и физической нагрузки, особенно в детстве. Плюс болезни.
Да что там, по черепам тоже как-то не очень входит (надо знать характерные для данной группы людей толщины тканей). Поэтому даже по одному черепу получаются разные результаты, разумеется для древних черепов.
Плюс форма носа

Евгений Степанищев 2020

Как почему не очень получается по костям черепа — очевиднее. А по ДНК — тут мне непонятно.

Очень многое зависит от питания и физической нагрузки, особенно в детстве.

Получается, разлучённые в детстве близнецы должны выглядеть по-разному, но я что-то такого не смог нагуглить.

Помимо этого, в интернете иногда попадаются работы по восстановлению облика преступника. Там пока немногое могут, но вроде какие-то черты вообще однозначно восстанавливают.

PastorGL 2020

В дополнение предыдущего комментатора, есть ещё и эпигенетические изменения (тут надо погуглить про метилирование). Соответственно, даже с полностью восстановленным сиквенсом невозможно точно сказать, насколько конкретный ген был активен в реальности в конкретной ткани у конкретного индивида, и насколько определяемый им признак был выраженным.

Короче: точно невозможно. Приблизительно можно, но весьма приблизительно.

Евгений Степанищев 2020

…невозможно точно сказать, насколько конкретный ген был активен в реальности в конкретной ткани у конкретного индивида, и насколько определяемый им признак был выраженным.

А от чего это зависит?

Денис Ибаев 2020

Это уже делают, например, смотри https://elementy.ru/novosti_nauki/433540/Dannye_po_metilirovaniyu_DNK_pozvolili_vossozdat_oblik_denisovskogo_cheloveka Но как указали выше, без учёта эпигенетики облик достаточно точно восстановить не получится. Наверное, будут найдены какие-то обходные пути с использованием больших данных, типа «как правило в этой популяции метилирование было вот таким».

Евгений Степанищев 2020

Ты имеешь ввиду восстановление облика по ДНК? Разумеются делают, это широко в криминалистике используется и СМИ об этом давно трубят. Но там пока точность невелика — для цвета глаз результат хороший (9 из 10), а для всего остального пока посредственный — слишком много генов в комплексе влияют.

Про эпигенетику я ничего не знаю, прочитаю.

PastorGL 2020

А от чего это зависит?

Очень много от чего.

Гены же не работают как бинарный переключатель: вкл. — есть признак, выкл. — нет признака. Нет!

Очень много генов-регуляторов, которые управляют каскадами активности зависимых генов. Хуже всего, что они параллельные и накладываются с перекрытием. У группы генов может быть несколько регуляторов, и наоборот, один ген может регулировать сразу несколько каскадов. Соответственно, если у индивида из какой-то популяции окажутся чуточку по-другому метилированы хотя бы некоторые регуляторные гены, его фенотип будет непредсказуемо изменён относительно его собратьев. А всего то достаточно, чтобы мать этого индивида, например, сильно переволновалась на каком-то месяце беременности. Или пила последние пару лет воду с каким-то нетипичным для неё ранее загрязнителем. Или ещё что, факторов множество.

К тому же, паттерн метилирования ещё наследуется, как правило, на пару поколений вперёд. Так что всяких переменных возникает слишком уж дофига. Кто знает, что там было с бабушкой или дедушкой интересующего нас индивида, и как оно повлияло на его форму ушей.

Евгений Степанищев 2020

Я почитал немного про эпигенетику, стало понятнее, но не сильно — область непростая.

Часть вещей, как я понял, наследуется (значит у потомков берём не только ДНК), часть известна (например, пол, а он влияет), часть может быть вычислена (например, есть фотографии братьев/сестёр), вопрос насколько оставшиеся изменения критичны для создания портрета.

По большому счёт интересует ведь только лицо, тип телосложения и примерный рост. С лицом сложнее всего — много вариаций, но некоторые отклонения там не важны, их глаз просто не заметит, другие — несущественны (скажем, я по-разному выгляжу в разное время дня и ничего).

В общем, вопрос о том может ли быть восстановлен облик, скажем, моего прадеда по его потомкам и боковым веткам для меня всё ещё открыт.

Или всё же есть какие-то работы, которые эту возможность перечёркивают?

Sergey Andryukhin 2023

Глядя на фотографии родственников по одной линии, я заметил, что иногда внешность очень сильно наследуется даже через два-три поколения, но это какая-то редкость. Возможно есть какой-то доминантный механизм, который делает override генам второго родителя по внешности. Но этот пример мне как раз и дает повод думать, что то, как выглядит лицо — должно все таки кодироваться в ДНК, и миксоваться от обоих родителей, если это не доминантная внешность.